微生物肥料生产的原料一般都是农副产品，辅料一般是农业废弃物，这些资源是可再生的，也可以解决废弃物利用问题，是可持续的。用到土壤里，普遍反映，可以改善土壤结构，可以持续减少土传病害的发生。

　　功效方面，化肥就是提供营养元素氮磷钾等。微生物肥料不直接提供营养元素，它的功能是多样的，有提高肥料利用率，有促生的，有防病的，有提高耐盐耐碱耐寒等提高抗逆性的，是功能性的产品。普遍反映，用了微生物肥料有防止土壤板结，改善农产品品质，符合环保要求。

　　总体而然，微生物产品绿色环保，不污染土壤。

　　产业存在的痛点：效果慢，没有化肥效果那么明显，见效没有那么快。成本偏高，在小麦、玉米、水稻等大田作物的推广施用上还有一定的成本难度。

　　微生物肥料应用技术要求相对较高，不像化肥使用起来那么简单。因为微生物肥料是活的生物体，不能和某些杀菌剂混合使用，有些微生物肥料不能和有些化肥一起使用(如容易释放铵离子的化肥)，因为许多微生物对铵离子很敏感，混合施用对菌剂的影响还是很大的。再一个，微生物肥料施用的时机需要提前，不能像化肥一样看到缺肥再去施用。

　　微生物肥料最大的问题是产品质量的稳定性问题。各个厂家或者同一厂家不同批次产品的质量的稳定性存在问题。

　　这是因为微生物肥料本身的特性决定了产品质量比较难把控，再一个，部分厂家可能不注重产品质量稳定性的控制(难度大，也看不出来)。造成产品质量参差不齐，致使田间效果不稳定(不同区域、不同年份效果表现不一致)，微生物肥料、制剂要是能解决这个问题，我觉得这个产业未来还是能有更大的发展的。

　　微生物肥料标准中，一般生物菌肥的保质期为3-6个月，实际操作中是有难度的，除芽孢杆菌以外，大部分其它微生物制品3个月是相对稳定的保质期，3个月之后就开始大量死亡。

　　保质期短，这是由微生物肥料的特性决定，而生产——销售——施用整个过程，就不一定能在3个月内完成。产品放的时间长了，导致效果会大大降低。有些企业技术力量可能也不太很雄厚，对这方面管控也不是很严格。质量管控得好的话，产品功效还是有保障的。